Njemačka vojska je tijekom 1944. godine okupirala više od 4.300 četvornih metara crkvenih prostora u Širokom Brijegu, uključujući sjemenište, gimnaziju, konvikt i značajan dio samostana. Ovi su prostori korišteni za smještaj vojske, opreme, te njemačke bolnice koja je u gimnaziji djelovala od 16. studenog 1943. godine. Detalji o opsegu okupacije i zahtjevima za odštetu otkriveni su u dokumentima Digitalnog arhiva Široki Brijeg, uključujući službeni dopis Provincijala fra Lea Petrovića iz travnja 1944. godine.
Okupacija je započela krajem 1943. godine, pri čemu je gimnazija s inventarom zauzeta 16. studenog, istog datuma kada je zauzeto i sjemenište te konvikt za eksterniste. Samostan je, u dvije trećine svojih prostorija, zauzet sredinom siječnja 1944. godine. Fotografija iz 1944. godine, koju je snimio fra Bruno Adamčik, prikazuje njemačkog dočasnika s medicinskom sestrom ispred ulaznih vrata gimnazije, što potvrđuje njezinu prenamjenu u vojnu bolnicu. Medicinska sestra je, prema odori, pripadnica Wehrmachtovih vojnih bolničarki.
Suočen s opsežnom okupacijom, Provincijal fra Leo Petrović je 7. travnja 1944. godine službenim dopisom broj 198/44. poslao pismo „Platzkommandu u Mostaru“. U dopisu je priložio popis zauzetih prostora na Širokom Brijegu, Humcu i u Tomislavgradu, uz molbu za strogo poštivanje samostanskog prostora i klauzure. Posebno je zatraženo da u ove prostore ne zalaze ženske civilne osobe, te da se gvardijani na spomenutim mjestima dogovore sa zapovjednicima jedinica o visini odštete za oduzeti prostor i sav inventar. Među konkretnim zahtjevima bili su mjesečno plaćanje za korištenje, uklanjanje ženskih osoba koje nisu sanitetsko osoblje iz samostanskih prostorija, te paušalna naknada za habanje i korištenje objekata.
Na Širokom Brijegu, njemačka vojska je zauzela 18 prostorija sjemeništa (403 m²) s krevetima, knjigama i ormarima. U samostanu su zauzete dvije trećine prostorija, ukupno 26 prostorija s 548 m², uključujući i pomoćne zgrade s inventarom poput kreveta, knjiga, ormara, stolova, stolica i rasvjete. Gimnazija je zauzeta u potpunosti, obuhvaćajući 48 prostorija s 2.177,71 m², s cjelokupnim inventarom stolova, stolica, ormara za knjige i klupa. Konvikt za eksterniste zauzet je s 19 prostorija i 1.210 m², s inventarom koji je uključivao 152 kreveta, 136 posteljina, 152 noćna ormarića, 152 stolice, 8 stolova i 79 pultova. Ukupna površina zauzetih prostora u Širokom Brijegu iznosila je preciznih 4.338,71 četvornih metara.
Dokumentacija, koja se nalazi u Arhivu Hercegovačke franjevačke provincije (SP SV 148., folija 71. – 73.), objavljena je i u knjizi „FRANJEVAČKA KLASIČNA GIMNAZIJA NA ŠIROKOM BRIJEGU“ autora fra Ante Marića. Ove informacije pružaju uvid u izazove s kojima su se lokalne crkvene institucije suočavale tijekom ratnih godina u Bosni i Hercegovini.
